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Les tests ADN expliqués pour connaître ses origines

Première étape : collecter un échantillon de salive dans un tube

saliveLe génome humain est constitué d’environ 3 milliards de paires de bases – les lettres d’instructions individuelles de notre code génétique – qui constituent le génome humain. Lorsque vous crachez dans un tube et que vous l’envoyez à une société, ils ne prennent pas la peine de regarder chaque lettre. Ce serait exagéré.

Tous les humains ont environ 99,9 % de leur ADN en commun. Donc, pour accélérer le processus, les tests recherchent plutôt les endroits du génome où les gens diffèrent généralement les uns des autres.

Ce sont des endroits où vous pourriez avoir le nucléotide (la molécule qui forme la moitié d’une paire de bases). C’est tout. Au total, ces changements d’une seule lettre dans notre ADN peuvent aider à expliquer pourquoi une personne est plus grande qu’une autre, ou pourquoi une personne a les yeux marrons et une autre les yeux verts.

Dans le jargon scientifique, ces variations sont appelées polymorphismes de nucléotides simples, ou PNS. Les entreprises peuvent analyser un demi-million de PNS ou plus dans le cadre d’un test d’ascendance.

Lorsqu’une entreprise de tests génétiques reçoit un tube de votre salive par la poste, elle doit d’abord en extraire l’ADN. « Vous enlevez les débris cellulaires, les protéines, toutes les choses qui ne sont pas de l’ADN« , explique François Dupont. Ils font des copies de votre ADN, puis les cassent en morceaux plus courts.

Ces morceaux sont ensuite introduits dans une machine appelée « tableau de génotypage ». Ces matrices – et c’est une simplification absolue – fonctionnent comme une machine à trier les pièces de monnaie, mais pour les PNS. Elles indiquent aux entreprises les versions de PNS dont vous avez hérité et leur emplacement dans le génome.

De nombreux PNS n’ont aucun sens lorsqu’il s’agit de notre santé. Mais ils peuvent être des points de départ utiles pour retracer l’ascendance. En effet, comme tout le reste de notre génome, les PNS sont transmis de génération en génération. Plus nous avons de PNS en commun avec une autre personne, plus il est probable que nous ayons une ascendance similaire et plus récente. Votre ascendance est estimée en comparant les résultats de votre PNS avec une base de données génétiques de personnes ayant des ascendances connues (plus d’informations à ce sujet dans la section suivante).

Voici la première source de divergences potentielles dans les tests d’ascendance : Même si ces matrices de génotypage sont extrêmement précises, elles sont sujettes à de minuscules erreurs.

« Nous parlons d’une précision de 99,9 % pour ces puces« , explique Françcois. Mais même avec ce niveau élevé de précision, lorsque vous traitez un million d’endroits dans le génome, vous pouvez obtenir 1 000 erreurs. Ces petites erreurs peuvent expliquer à elles seules pourquoi les résultats d’un jumeau peuvent être légèrement différents de ceux d’un autre. (Cette source d’erreur explique pourquoi les résultats de santé que vous obtenez des sociétés de tests génétiques peuvent également présenter des divergences).

Deuxième étape : votre ADN est comparé à celui d’autres personnes ayant des ancêtres connus

Mis à part les erreurs, les génotypes que nous recevons de chacune des sociétés de test des consommateurs devraient être à peu près identiques les uns aux autres. Mais la façon dont les entreprises analysent ces données brutes varie. Et c’est pourquoi les résultats d’une entreprise en matière d’ascendance peuvent sembler un peu différents de ceux d’une autre.

Voici comment cela fonctionne.

Les entreprises comparent votre ensemble de PNS à des groupes de référence connus. Un test ADN origine vise à prouver que vous avez des ancêtres communs avec des personnes du groupe de référence.

Mais le groupe de référence utilisé par chaque société peut être différent. Et les groupes de référence changent tout le temps.

Une autre limite : Ces groupes de référence sont largement basés sur les personnes qui déclarent elles-mêmes leur ascendance. Ces personnes peuvent être assez sûres de savoir d’où vient leur famille, mais ce n’est pas une mesure parfaite.

Les sociétés d’ADN d’ascendance peuvent souvent retracer l’ADN européen vers des pays spécifiques. Mais si vous êtes une minorité, votre rapport peut être plus vague.

« Imaginez que vous venez d’une petite ville d’Espagne« , dit François. « Si [les sociétés de test] ont un groupe de personnes de cette petite ville, elles peuvent vous comparer à eux de manière très efficace. Mais s’ils n’ont pas de gens de cette petite ville en particulier, ils pourraient simplement déterminer que vous êtes globalement espagnol, ou européen. »

Étape 3 : un programme informatique fait une estimation de votre composition ancestrale

Il reste une dernière étape à franchir : Ces entreprises ne se contentent pas de vous faire correspondre à vos ancêtres, elles vous attribuent des pourcentages très précis. Ainsi, un test ADN d’ascendance peut révéler que vous êtes 23 % européen, 24 % chinois, etc.

C’est là qu’interviennent les programmes informatiques. L’algorithme dit : « Essayons de rassembler les ancêtres dans différentes combinaisons, pour obtenir une variation similaire [des PNS] que vous avez », explique François.

Il s’agit de rechercher la meilleure concordance, pas une concordance parfaite.

Et c’est imparfait, surtout pour différencier des ancêtres qui semblent très similaires génétiquement.

« Il y a très peu de variation [génétique] en Europe », dit François, à titre d’exemple. « Les Anglais, par exemple, n’ont pas vraiment l’air si différents génétiquement que les Irlandais, dit-il. L’ordinateur est donc plus susceptible de faire l’erreur que les ancêtres d’une personne étaient anglais (et non irlandais), que de faire l’erreur qu’une personne est anglaise (et non taïwanaise). »

De plus, les programmes doivent faire des suppositions sur le temps que vos ancêtres ont vécu dans un endroit particulier. Cela aussi est imparfait, avec une série d’erreurs.

Les programmes informatiques sont également sensibles aux petites erreurs intégrées dans le processus de génotypage. Et, encore une fois, le résultat du programme dépend de l’ADN de référence que l’entreprise possède dans sa base de données.

Rappelez-vous : L’ascendance de l’ADN n’est pas la même que l’héritage

Voici une autre chose qu’il est important de se rappeler : Les tests ADN d’ascendance ne vous disent pas où chaque membre de votre arbre généalogique a vécu. Ils vous indiquent plutôt la quantité de leur ADN dont vous avez hérité.

C’est pourquoi les frères et sœurs peuvent obtenir des rapports différents des services de l’ADN de l’ascendance (même s’ils partagent exactement les mêmes parents). « Il est possible que votre frère ait hérité d’un morceau d’ADN d’un de vos ancêtres que vous n’avez pas eu« , explique François.

Rappelez-vous que vous héritez de la moitié de votre ADN de votre mère et de l’autre moitié de votre ADN de votre père. Mais votre père ne vous transmettra peut-être pas tous les gènes qu’il a hérités.

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