Na počiatku 20. storočia sa Rím rozhodol, že obnoví diecézne štruktúry. Vzhľadom k rôznym revolučným udalostiam je však táto požiadavka opäť nastolená až pápežom Pavlom VI. a následneJánom Pavlom II. Miestni biskupi na základe tohto rozhodnutia vyzvali františkánov, aby doposiaľ spravované farnosti uvoľnili diecéznemu kléru.
To sa však nestalo, pretože niektorí františkáni, okrem iných aj tí z Medžugorja, odmietli nariadenieposlúchnuť. A to aj napriek tomu, že im poslúchnuť nariadil generál rádu! Výsledkom bolo suspendovanie otcov Ivica Vegu a Ivana Prusinu, ktorí sa najviac angažovali vo verejných protestoch proti miestnemu biskupovi, ako aj ich následné vylúčenie z rádu. OD POČÁTKU NEPOSLUŠNOST PROTI VRCHNOSTI @Coburg to není z hlavy Čejky a ani toto Čo sa týka okolností prvého zjavenia, tak tie sú prinajmenšom pochybné. Mirjana, jedna z údajných vizionárok, vtedajšiemu mostarskému biskupovi Žaničovi pod prísahou povedala, že išli hľadať stratenú ovcu. Keď bola upozornená na to, že vypovedá pod prísahou, pripustila, že v skutočnosti išli počúvať rockovú hudbu a fajčiť cigarety, ktoré ukradli svojim rodičom. Mirjana teda pod prísahou už od samého začiatku klamala. To nepopiera nikto zo zástancov Medžugorja, väčšinou však tento závažný hriech vysvetľujú rozrušením a strachom z výsluchu.